Anna-Karin Pernestig
Lektor i biovetenskap
Institutionen för biovetenskap
Rum G3306
Jag erhöll min magisterexamen i molekylärbiologi vid Göteborgs universitet 1997 och min doktorsexamen vid Karolinska institutet 2003. För närvarande är jag universitetslektor i biovetenskap vid Högskolan i Skövde.
Jag har även uppdrag som forskningsledare för forskargruppen Infektionsbiologi vid Forskningscentrum för Systembiologi samt som projektledare för Elitidrottsvänligt lärosäte.
Forskning
Publikationer
Projekt
Om min forskning
Sepsis är ett livshotande tillstånd som uppstår vid en kraftig infektion. Tidig diagnostik är avgörande, eftersom varje timmes fördröjning av behandling ökar risken för dödsfall. Trots att sepsis är vanligare än bröst-, prostata- och tarmcancer tillsammans, är det fortfarande ett relativt okänt tillstånd.
Vid Högskolan i Skövde samarbetar vi med Unilabs, Skaraborgs sjukhus och internationella företag för att utveckla diagnostiska metoder som möjliggör en tidigare identifiering av patienter med sepsis. Vår forskning fokuserar på två områden:
- identifiering av mikroorganismer i blodet hos septiska patienter
- mätning av biomarkörer för att tidigt upptäcka sepsis.
Vi använder bland annat Next Generation Sequencing (NGS) för att kartlägga bakteriers hela arvsmassa. Denna teknik möjliggör snabb och kostnadseffektiv identifiering av bakterier, deras antibiotikaresistens och virulensfaktorer. Tillsammans med Clinical Genomics vid SciLifeLab har vi sekvenserat närmare 800 bakterieisolat, inklusive E. coli, Staphylococcus, Streptococcus och Klebsiella.
Vi har också utvecklat presumtiva multimarkörpaneler med potential att identifiera patienter med bakteriellt orsakad sepsis. Dessa paneler kombinerar biologiska och kliniska markörer för att förbättra diagnostiken. Dessutom arbetar vi med att utveckla kvalitetskontroller för att optimera användningen av multimarkörpanelen i klinisk diagnostik.
2023
BMC Infectious Diseases
2023. Artikel.
https://doi.org/10.1186/s12879-022-07977-0
2022
Microbial Pathogenesis
2022. Artikel.
https://doi.org/10.1016/j.micpath.2022.105836
Nätverksträff för Forskningsbibliotekens pedagogiska roll, Göteborg, 24-25 november, 2022
2022. Konferensbidrag, muntlig presentation med abstract.
2021
Frontiers in Microbiology
2021. Artikel.
https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.640408
2019
Evaluation of QuickFISH and maldi Sepsityper for identification of bacteria in bloodstream infection
Infectious Diseases
2019. Artikel.
https://doi.org/10.1080/23744235.2018.1554258
14th Annual Workshop in Systems Biology, University of Skövde, Sweden, 21 November 2019
2019. Konferensbidrag, poster.
14th Annual Workshop in Systems Biology, University of Skövde, Sweden, 21 November 2019
2019. Konferensbidrag, poster.
29th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, ECCMID, Amsterdam, Netherlands, 13-16 April, 2019
2019. Konferensbidrag, poster.
29th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, ECCMID, Amsterdam, Netherlands, 13-16 April, 2019
2019. Konferensbidrag, poster.
2018
Laboratory Investigation
2018. Artikel, forskningsöversikt. https://doi.org/10.1038/s41374-018-0143-3
2017
2015
2014
2013
2012
2006
2005
2003
2002
2001
2000
Avslutade projekt
miRSeps – framtida diagnostik av sepsis
Detta projekt är ett av flera pågående projekt inom forskningen "Framtida diagnostik av sepsis". Målet är att utveckla tidigare och mer korrekt diagnostik vid sepsis i syfte att öka drabbade patienters chans att överleva och med mindre sjukdomskomplikationer.
Januari 2020 - Juni 2023 SystembiologiData-mining för identifiering, selektion och validering av biomarkörer
Inom BioMine-projektet studerar vi möjligheterna att använda storskalig biologisk data för att identifiera och validera biomarkörer inom Life-Science-området. Biomarkörer blir allt viktigare inom det biomedicinska området, och det finns ett växande behov av att identifiera nya markörer för diagnostik av sjukdomar och sjukdomsprogression.
Oktober 2017 - Maj 2022 SystembiologiBiomarkörer för klinisk diagnostik
Detta projekt är ett av flera pågående projekt inom forskningen "Framtida diagnostik av sepsis". Målet är att utveckla tidigare diagnostik vid sepsis i syfte att öka drabbade patienters chans att överleva och med mindre sjukdomskomplikationer. Projektet, Biomarkörer för klinisk diagnostik, är ett av tre delprojekt inom BioMine – data-mining för identifiering av biomarkörer.
Oktober 2017 - September 2021 SystembiologiSMARTDIAGNOS – snabb detektion av sepsis
Detta projekt är ett av flera pågående projekt inom forskningen "Framtida diagnostik av sepsis". Målet är att utveckla tidigare diagnostik vid sepsis i syfte att öka drabbade patienters chans att överleva och med mindre sjukdomskomplikationer.
Februari 2016 - Januari 2020 SystembiologiSepsIT® - utveckling av diagnossystem för sepsis
Detta projekt är ett av flera pågående projekt inom forskningen "Framtida diagnostik av sepsis". Målet är att utveckla tidigare diagnostik vid sepsis i syfte att öka drabbade patienters chans att överleva och med mindre sjukdomskomplikationer.
Oktober 2016 - September 2019 SystembiologiUtveckling av multimarkörpaneler för sepsisdiagnostik
Detta projekt är ett av flera pågående projekt inom forskningen "Framtida diagnostik av sepsis". Målet är att utveckla tidigare och mer korrekt diagnostik vid sepsis i syfte att öka drabbade patienters chans att överleva och med mindre sjukdomskomplikationer.
Januari 2014 - December 2016 Systembiologi